Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMPQ9Y244 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms