Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC2Q9Y235 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms