Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNEQ9Y223 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GNEQ9Y223 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNEQ9Y223 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNEQ9Y223 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNEQ9Y223 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms