Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms