Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC12A4Q9UP95 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms