Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCG2Q9UNQ0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCG2Q9UNQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCG2Q9UNQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCG2Q9UNQ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCG2Q9UNQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCG2Q9UNQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms