Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms