Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms