Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms