Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms