Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP21Q9UK80 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms