Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCTN4Q9UJW0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DCTN4Q9UJW0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms