Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms