Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms