Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms