Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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