Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHORDC1Q9UHD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms