Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms