Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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