Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms