Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23BQ9NYZ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms