Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms