Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms