Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms