Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms