Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms