Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms