Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms