Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC2Q9NRP2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms