Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms