Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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