Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP3Q9H9T3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms