Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms