Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms