Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC2Q9H6S0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms