Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms