Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms