Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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