Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms