Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms