Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX6-2Q9C056 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms