Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms