Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms