Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF3BQ9BZI7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms