Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms