Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA7Q9BWT1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms