Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms