Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSCC1Q9BVC3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms