Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms