Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms